Согласно положениям Закона от 27.11.2018 № 422-ФЗ самозанятые освобождаются от уплаты НДФЛ касательно доходов, с которых уплачивается налог на профдоход (ч. 8 ст.2).
Если компания выплачивает вознаграждение самозанятому, то у нее не возникают обязанности налогового агента по удержанию НДФЛ при условии, что такие доходы облагаются налогом на профдоход.
В отношении страховых взносов следует учитывать, что ч. 1 ст. 15 Закона от 27.11.2018 № 422-ФЗ освобождает организации от обязанности перечислять взносы с выплат самозанятым без статуса ИП, учитываемым в базе по НПД, если у плательщика имеется чек от самозанятого.
Разъяснения дали представители Минфина РФ в письме от 17.02.2020 № 24-03-08/10748.